テーブルからクラドグラム メーカーを設計することについて心配していますか? ここでは、非常に役立ついくつかのクラドグラム メーカーを紹介します。
私たちが子供の頃、類人猿は人間の祖先であり、私たちは食物連鎖に関連しているなど、誰もが何らかの形で互いに関連していることを生物学で読みました.
クラドグラム ツリーは、DNA 配列、身体的特徴、および表現型に基づいて、生物間の祖先の関係を表します。 これは、同様の機能、進化の物語、および適応に基づいて各クレードを分類できる進化ツリーです。 最も可能性の高い仮説は、比較および描画されたクラドグラムに基づいて決定されます。
線を使用して、他の祖先または生物のグループとのクレードの方向を表します。 仮説上の祖先を表す開始クレードと終了クレードへの線を簡単にたどることができます。
必要に応じて、行動データ(動物用)を用いて分子・形態レベルで生物を分類します。 クラドグラム生成アルゴリズムは、入力データに基づいて最適化タスクを実行するために使用されます。 目的は、グローバル ミニマムの問題を解決することであり、最適なソリューションを確実に見つけられるシミュレートされたアニーリング アプローチが推奨されます。
そうは言っても、選択できるクラドグラムツールのリストは次のとおりです。
創造的に
との関係を簡単に視覚化 創造的に 種間のつながりを表現するクラドグラムメーカー。 系統関係を効果的に特定して視覚化するのに役立ちます。 次のような機能を持つさまざまな生物種を表すのに最適な方法です。
- 印刷および共有用にエクスポートする PDF、SVG、および PNG 画像
- 系統発生図およびクラドグラム図用の複数のテンプレート
- キャンバス上で関係を簡単に視覚化
二分キー、食物網、系統樹、生物をグループ化するための複数のテンプレートなど、広範な形状ライブラリを提供します。 このツールは、シンプルなドラッグ アンド ドロップ機能を提供し、高度なテキスト形式と構成可能なカラー テーマを使用して簡単に関係を作成できます。
動物の画像と動的コネクタをドラッグ アンド ドロップして創造的に提供し、図をシームレスに拡大、回転、サイズ変更します。 組み込みの Google 画像を使用して動的なクラドグラムを作成し、無限のキャンバス、ユニバーサルな全文検索、組み込みツール、多用途のテーブルが満載の研究データを一元化します。
リアルタイム カーソル、ディスカッション用のコメント セクション、およびビデオ会議を使用して、他のユーザーと簡単にコラボレーションできます。
インサイトメーカー
インサイトメーカー は、Web ブラウザーでモデルを構築する単純化された形式です。 カジュアルなループ図や豊富な画像を簡単に作成し、Insight Maker を使用してあらゆる要件のシミュレーションを作成できます。 これは、集団の相互作用を迅速に刺激し、エージェントの動作を定義するのに役立ちます。
Insight Maker は簡単に使用できます。
- プラグインやダウンロードを必要とせずに、Web ブラウザーでツールを起動します
- アイデアをキャンバスに配置して、シミュレーション モデル、豊富な画像、洞察を作成します
- シミュレーション アルゴリズムを使用して、エージェントベースおよびシステム動的モデリングから開始する
- チームと協力して、デザインに関する意見も送ってもらいます
- モデルを無料で作成し、創造力を活用
その上、ユーザーはクラドグラムにアイデアを取り入れ、他の人が取り組んでいることを確認できます。 ブレーンストーミングを行い、最善の解決策を考え出すのに役立ちます。
グリフォード
SimpleClade を使用する グリフォード 理想的な分岐分析を考え出すために。 古生物学クラスで簡単な作業方法を設計するためのグラフィカル ユーザー インターフェイスを提供します。 これに加えて、このツールは使いやすく、ソフトウェアをインストールして、すぐに使い始めることができます。
ユーザーは CSV データ ファイルを作成し、クレードの生成を開始できます。 セルを使用するプロセス全体には、すぐに習得できる差別化された価値が含まれています。 ユーザーは、使用していないクレード「UNUSED」をマークし、他のクレードの値を入力できます。
ユーザーは、プログラム操作から始めて、クエリを説明できるノードを選択し、必要に応じて接続を変更し、倹約統計を計算し、アウトグループの水平ルート ステムを接続し、特性状態の変化を表示できます。
IUBio
IUBio は、クラドグラム、ユーログラム、スウーポグラム、曲線図、フェノグラム、およびツリー図を作成するために使用されるもう 1 つの一般的なツールです。 使い方は簡単で、ツリーファイルをアップロード (または URL を貼り付け)、タイトルを記載し、詳細を送信します。
ユーザーは、IUBio の追加オプションを選択して、ラベル、スタイル、フォント、サイズなどのベース URL など、必要な出力を取得することもできます。また、ツリーの成長とノードの位置から選択して、見栄えを良くすることもできます。
このオンライン ツールは、節足動物、DroSpeGe、enGenes、wFleaBase など、いくつかのものを扱います。 バイオインフォマティクスと分子生物学のユーザーに公開アクセスを提供します。 IUBio には、ショウジョウバエのゲノム、シーケンス解析、バイオ シーケンス変換、およびあらゆる用途のエディターが含まれています。
結論
樹木のクラドグラム メーカーを使用すると、進化の系統を分岐とヌクレオチド置換の遺伝的変化の数で表すことができます。 シーケンスの変化率に基づいて変電所を表すことも簡単です。
これに伴い、ブランチとノード (内部ノードと外部ノード – 葉と先端) に注目するときは、ツリー構造を維持する必要があります。 この図には、究極の共通祖先を突き止めるための分子時計も含まれています。
必要な結果を得るために、クラドグラム マーカーを使い始めます。